มหาวิทยาลัยมหามกุฏราชวิทยาลัย วิทยาเขตศรีล้านช้าง ได้ดำเนินการจัดการศึกษามาตั้งแต่ปี ๒๕๓๖ โดยในระยะแรกเป็นห้องเรียนของวิทยาเขตอีสาน จังหวัดขอนแก่น ต่อมาในปีพุทธศักราช ๒๕๓๘ จึงได้รับการยกฐานะเป็นวิทยาเขตตามมติที่ประชุมครั้งที่ ๑/๒๕๓๘ เมื่อวันที่ ๒๘ มีนาคม ๒๕๓๘ จนกระทั่งถึงปัจจุบัน และมีผู้บริหารของวิทยาเขตตามลำดับ ดังนี้
รองอธิการบดี

รองอธิการบดี รูปที่ ๑
พระราชสุเมธี
(กิตติกร สุจิณฺโณ/ชุมพล)
๒๕๔๐ – ๒๕๔๓

รองอธิการบดี รูปที่ ๒
พระครูกิตติสารสุมณฑ์
พระราชวชิรสุธี ในปัจจุบัน
(สุพัฒน์ สุวฑฺฒโน/ดอกไม้)
– ๒๕๔๔ – ๒๕๕๓
– ๒๕๕๕ (รักษาการ)
– ๒๕๕๖ – ๒๕๕๗

รองอธิการบดี รูปที่ ๓
พระราชปริยัติวิมล
(สายัณห์ ปญฺญาวชิโร)
๒๕๕๔ (รักษาการ)

รองอธิการบดี รูปที่ ๔
พระครูปริยัติสาทร, ดร.
(วราวุธ สีลาวุโธ/ราชา)
๒๕๕๘ – ๒๕๖๒

รองอธิการบดี รูปที่ ๔
พระสุทธิวชิรเมธี, ดร.
(วิเชียร ธมฺมวชิโร)
๒๕๖๒ – ปัจจุบัน
ผู้ช่วยอธิการบดี

ผู้ช่วยอธิการบดี ลำดับที่ ๑
นายขันทอง พรมทา
๒๕๔๐ – ๒๕๔๑

ผู้ช่วยอธิการบดี ลำดับที่ ๒
รศ.ดร. ภาสกร ดอกจันทร์
๒๕๔๒ – ๒๕๕๔

ผู้ช่วยอธิการบดี ลำดับที่ ๓
ผศ.ดร. ชิษณพงศ์ ศรจันทร์
– ๒๕๕๕ (รักษาการ)
– ๒๕๕๖ – ๒๕๕๗

ผู้ช่วยอธิการบดี ลำดับที่ ๔
รศ.ดร. สุขพัฒน์ อนนท์จารย์
๒๕๕๘ – ๒๕๖๒

ผู้ช่วยอธิการบดี ลำดับที่ ๕
ผศ.ดร. จักรกฤษณ์ โพดาพล
๒๕๖๒ – ๒๕๖๖
